Высокопроизводительная протеомика: краткий методологический обзор

В постгеномную эпоху протеомика играет важную роль в биомедицинских исследованиях. Благодаря технологическому прорыву и появлению новых вычислительных и статистических моделей методы протеомного анализа стремительно развивались в последнее десятилетие, помогая решать сложные биомедицинские задачи. В обзоре обобщены данные о применении существующих и новых высокопроизводительных протеомных методов в научных исследованиях и клинической практике: масс-спектрометрии, белковых массивов для анализа сигнальных путей, тканевых микроматриц нового поколения, протеомики отдельных клеток и отдельных молекул, а также платформ Luminex, Simoa и Olink Proteomics. Обсуждаются вычислительные методы и статистические алгоритмы, позволяющие эффективнее анализировать протеомные данные в сочетании с клиническими данными и/или данными других омиксных исследований. Приведены принципы и меры предосторожности, необходимые для эффективного использования этих инструментов. Развитие высокопроизводительной протеомики помогает глубже понять молекулярные механизмы патогенеза и выявить характерные для отдельных заболеваний сигнальные сети. Современные протеомные методы могут применяться в фундаментальных исследованиях, онкологической прогностике, прецизионной медицине и разработке лекарственных препаратов.