Представление данных об обеспечении и контроле качества при ненаправленном метаболическом фенотипировании: рекомендации mQACC по управлению аналитическим качеством

Введение: Подтверждение высокого качества данных, полученных в исследованиях метаболического фенотипирования (метаболомики/метабономики), приобретает всё большее значение для признания результатов таких исследований. Важный и постоянно развивающийся аспект этой работы — применение общепринятых протоколов контроля качества, включая использование надлежащих образцов контроля качества. Однако неполное или некорректное описание процедур обеспечения и контроля качества, применявшихся в исследовании, может привести к неверной интерпретации результатов или чрезмерному акценту на них, а также затруднить последующий метаанализ совокупности полученных данных.

Цель: Предложить исследователям основу для описания процедур и результатов оценки и контроля качества при использовании масс-спектрометрии и спектроскопии ядерного магнитного резонанса в ненаправленной метаболомике. Особое внимание уделяется достаточно подробному описанию образцов контроля качества, чтобы их можно было понять, оценить степень доверия к ним и воспроизвести работу с ними. Цель рекомендаций — не предписывать передовые методы аналитической работы, а предложить подход к описанию процедур обеспечения и контроля качества. В качестве интернет-ресурсов предоставлены шаблон, который можно заполнять по мере выполнения исследования для сбора необходимых данных, и дополнительные документы.

Основные принципы представления данных: При описании протоколов и результатов контроля качества данных метаболического фенотипирования следует учитывать ряд вопросов. Необходимо описывать назначение, источники, виды, подготовку и применение материалов и образцов контроля качества, используемых при получении метаболомных данных. Также рассматриваются матрицы образцов и их подготовка, применение тестовых смесей и проверок пригодности системы, холостые пробы и факторы, специфичные для конкретного метода; предлагаются способы представления этих сведений, в том числе подчёркивается важность указания критериев приемлемости для образцов контроля качества. Для описания образцов контроля качества и результатов их анализа предусмотрены два уровня детализации: «минимальный» и «наилучшая практика представления данных».