UniProt: универсальная база знаний о белках в 2023 году

Цель базы знаний UniProt — предоставить пользователям полный, высококачественный и свободно доступный набор белковых последовательностей с функциональными аннотациями. В этой публикации описаны усовершенствования конвейера обработки данных и веб-сайта, выполненные с учётом постоянно растущего объёма информации. Число последовательностей в UniProtKB превысило 227 млн; мы работаем над включением референсного протеома для каждой таксономической группы. Мы продолжаем извлекать подробные аннотации из научной литературы для обновления или создания курируемых записей, тогда как некурируемые записи дополняются аннотациями, полученными автоматизированными системами с использованием различных методов машинного обучения. Кроме того, научное сообщество продолжает вносить публикации и аннотации в интересующие его записи UniProt. Наконец, мы описываем новый веб-сайт (https://www.uniprot.org/), разработанный для улучшения взаимодействия пользователей с ресурсом и упрощения доступа исследовательского сообщества к данным. Интерфейс обеспечивает доступ к структурам AlphaFold более чем для 85% всех записей, а также предлагает улучшенные средства визуализации субклеточной локализации белков.