YaHS: ещё один инструмент для построения скаффолдов по данным Hi-C
YaHS: yet another Hi-C scaffolding tool
Аннотация
Сводка: Представлен YaHS — удобный инструмент командной строки для построения скаффолдов хромосомного уровня на основе данных Hi-C. Для его запуска достаточно одной команды и минимального набора входных данных — файла сборки и файла выравниваний, совместимых с аналогичными инструментами. YaHS формирует результаты сборки в нескольких форматах, обеспечивая быстрое, надёжное и масштабируемое построение высококачественных геномных сборок с высокой точностью и непрерывностью.
Доступность и реализация: YaHS реализован на языке C и распространяется по лицензии MIT. Исходный код, документация и учебное руководство доступны по адресу: https://github.com/sanger-tol/yahs.
Дополнительная информация: Дополнительные данные доступны онлайн в журнале Bioinformatics.
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.