Исчерпывающий перечень бактериальных патогенов, вызывающих инфекции у человека

Существует огромное разнообразие бактерий, способных вызывать инфекции у человека, однако актуального общедоступного перечня таких микроорганизмов не было. На основе прагматичного определения патогенности и широкого поиска мы выявили 1513 бактериальных патогенов, способных инфицировать человека, сведения о которых опубликованы до 2021 года. Из них 73% были отнесены к установленным патогенам (вызывали инфекции как минимум у трёх человек, о чём сообщалось не менее чем в трёх публикациях), а 27% — к предположительным (известно менее трёх случаев). Виды патогенов относятся к 10 типам и 24 классам, распределённым по всему филогенетическому древу бактерий. Мы показали, что новые патогены человека выявляются с высокой скоростью. Наконец, мы обсудили возможность расширения полученных результатов до базы данных, которая могла бы стать полезным ресурсом для микробиологов. Наш перечень находится в свободном доступе и архивирован на GitHub и Zenodo; для упрощения доступа и использования мы также подготовили пошаговые инструкции.