DRAVP: комплексная база данных противовирусных пептидов и белков

Вирусы, быстро размножающиеся и легко мутирующие, могут приобретать устойчивость к противовирусным препаратам. В связи с появлением новых вирусных инфекций, таких как недавняя пандемия COVID-19, необходимы новые методы противовирусной терапии. Противовирусные белки, например интерферон, применяются для лечения хронического гепатита C уже несколько десятилетий. У природных антимикробных пептидов, таких как дефензины, также выявлена противовирусная активность: они могут непосредственно подавлять вирусы и запускать опосредованные иммунные реакции против них. Для содействия разработке противовирусных препаратов мы создали базу данных противовирусных пептидов и белков DRAVP. В базе представлены общие сведения, данные о противовирусной активности, структуре и физико-химических свойствах пептидов и белков, а также библиографическая информация. Поскольку для большинства белков и пептидов экспериментально определённые структуры отсутствуют, для прогнозирования структуры каждого противовирусного пептида использовали AlphaFold. Для удобства поиска данных и анализа последовательностей создан бесплатный веб-сайт (http://dravp.cpu-bioinfor.org/, дата обращения — 30 августа 2022 года). Все данные также доступны через веб-интерфейс. База DRAVP призвана стать полезным ресурсом для разработки противовирусных препаратов.