Научная статья

OME-Zarr: облачно-оптимизированный формат файлов для биоизображений, поддерживаемый международным сообществом

OME-Zarr: a cloud-optimized bioimaging file format with international community support

Histochemistry and Cell Biology
10.1007/s00418-023-02209-1
Полный текст Открыть в журнале PubMed PMC
FWCI: 14.1FWCI — Field-Weighted Citation Impact (индекс цитируемости с поправкой на область науки). 1.0 = среднее, > 1 = выше среднего · Процитировано: 128 · Ссылки: 65 · Лицензия: CC-BY
Цитирование по годам: 2026: 41 · 2025: 36 · 2024: 38 · 2023: 13

Аннотация

Растущее сообщество разрабатывает формат файлов нового поколения (NGFF) для биоизображений, призванный решить проблемы масштабируемости и неоднородности данных. Специалисты и учреждения, работающие с различными методами визуализации и сталкивающиеся с этими проблемами, объединились под руководством Open Microscopy Environment (OME) и разработали процесс создания спецификации формата OME-NGFF. В статье участники этого сообщества описывают сам облачно-оптимизированный формат OME-Zarr, а также доступные на сегодняшний день инструменты и ресурсы с данными, которые расширяют доступ к данным в соответствии с принципами FAIR и снижают барьеры для научной работы. Нынешний интерес к этой разработке дает возможность унифицировать ключевой компонент биоизображений — формат файлов, лежащий в основе множества задач по управлению данными и их анализу на индивидуальном, институциональном и глобальном уровнях.

Переведем эту статью за 1 час

Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.

Попробовать бесплатно →

Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.