Обновление предложенных минимальных стандартов использования геномных данных в таксономии прокариот

Таксономия микроорганизмов — динамичная область, цель которой состоит в создании стабильной и актуальной системы классификации прокариот. Традиционная опора на фенотипические признаки ограничивала возможности всестороннего изучения разнообразия и эволюции микроорганизмов. Появление молекулярных методов, прежде всего секвенирования ДНК и геномных исследований, изменило представления о разнообразии прокариот. За последние два десятилетия развитие методов секвенирования генома привело к переходу от традиционных подходов к таксономии на основе геномных данных, которые используют для определения не только видов, но и таксонов более высокого ранга. По мере быстрого развития технологий и расширения баз данных важно поддерживать стандарты в актуальном состоянии. В этой работе предлагается пересмотреть рекомендации 2018 года по применению данных секвенирования генома в микробной таксономии и обновить минимальные стандарты и рекомендации с учетом технологического прогресса за прошедший период.