Система ДНК-штрихкодирования для таксономической верификации в рамках проекта «Древо жизни Дарвина»

Геномные исследования биоразнообразия требуют надёжной идентификации организмов, которая может быть затруднена при использовании только морфологических признаков. Идентификация на основе ДНК с помощью ДНК-штрихкодирования позволяет подтвердить видовую принадлежность и разрешить таксономические проблемы, однако этот метод редко применяют в исследованиях, направленных на получение референсных геномов. В настоящей работе описаны разработка и внедрение ДНК-штрихкодирования в рамках проекта «Древо жизни Дарвина» (DToL), целью которого является секвенирование и сборка высококачественных референсных геномов всех эукариотических видов Великобритании и Ирландии. Представлена стандартизированная система секвенирования ДНК-штрихкодов и интерпретации данных, адаптированная затем для различных групп организмов. Данные ДНК-штрихкодирования более чем 12 000 образцов DToL выявили необходимость дополнительной верификации до 20% образцов; впоследствии названия были изменены у 2% семенных растений и 3,5% образцов животных. Кроме того, предложены рекомендации по дальнейшему развитию метода с использованием новых подходов к секвенированию и оптимизированных биоинформатических методов.