Яркая и стабильная циановая флуоресцентная РНК обеспечивает многоцветную визуализацию РНК в живых клетках Escherichia coli

Флуоресцентные РНК (ФР) — это РНК-аптамеры, которые связывают соответствующие им малые флуорогенные красители и активируют их флуоресценцию. Они стали особенно полезным инструментом для визуализации РНК в живых клетках. Хотя палитра ФР значительно расширилась, по-прежнему необходима яркая и стабильная циановая ФР с хорошей биосовместимостью и биортогональностью по отношению к уже доступным ФР, однако такая молекула пока не создана. В этой работе описана Myosotis — РНК-аптамер, который при связывании с новым флуорофором DBT, структурно подобным хромофору GFP, испускает яркую циановую флуоресценцию. Myosotis обладает наномолярным сродством к DBT, а сворачивание аптамера слабо зависит от концентрации магния. Дальнейшие исследования показали, что комплекс Myosotis–DBT имеет длительное время жизни флуоресценции, отличается высокой фотостабильностью и повышает яркость сигнала в клетках. Кроме того, Myosotis–DBT биортогонален ФР Pepper и Clivia, что позволяет одновременно визуализировать несколько РНК в живых бактериях. Myosotis также можно использовать для визуализации мРНК в живых бактериях; полученные данные указывают на возможную связь между трансляцией мРНК и её стабильностью. Эта циановая ФР может стать полезным инструментом для изучения функций и механизмов действия РНК в различных биологических процессах.