MEGA12: молекулярно-эволюционный генетический анализ, версия 12, для адаптивных и экологичных вычислений

Представляем двенадцатую версию программного обеспечения Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA12). В новой версии значительно сокращено время, необходимое для выбора оптимальных моделей замещения и проведения бутстреп-тестов филогений методом максимального правдоподобия (ML). Это достигнуто благодаря эвристикам, позволяющим избежать вероятно избыточных вычислений. Анализ эмпирических и симулированных наборов данных показал, что применение этих эвристик существенно сокращает время вычислений без потери точности результатов. Кроме того, MEGA12 включает подход к разреженному обучению с учетом эволюционных связей, позволяющий выявлять неустойчивые клады и связанные с ними последовательности в эволюционных деревьях, построенных при филогеномном анализе. В эту версию также добавлены распараллеливание вычислений на более мелком уровне для анализа методом максимального правдоподобия, поддержка мониторов высокого разрешения и усовершенствованный инструмент Tree Explorer. MEGA12 можно скачать на сайте https://www.megasoftware.net.