Модификация клеточной стенки, опосредованная LicD, определяет чувствительность клинических изолятов Enterococcus faecalis к бактериофагам

Enterococcus faecalis стал распространённым возбудителем инфекций, устойчивым к антибиотикам. Мы выявили три новых литических бактериофага, активных против устойчивых к ванкомицину штаммов E. faecalis. Все выделенные фаги относились к роду Kochikohdavirus, однако различия в белках хвостовых фибрилл влияли на адсорбцию. Фаги проявляли выраженную антибактериальную активность и широкий спектр хозяев: они заражали более 90% исследованных клинических изолятов E. faecalis и изолятов из больничных сточных вод (n = 13), хотя эффективность заражения различалась. Различия в спектре хозяев на геномном уровне коррелировали с наличием гена licD у чувствительных к фагам бактерий. Этот ген отвечает за присоединение фосфорилхолина к клеточной стенке. Согласно прогнозу, геномы выделенных фагов содержали гены деполимераз; это подтвердили эксперименты in vitro, в которых биомасса биоплёнок уменьшилась более чем на 80%. Фаги подавляли рост бактерий не менее 12 ч, после чего появлялись мутанты, устойчивые к бактериофагам и в 4 раза более чувствительные к ванкомицину, чем исходные штаммы. Кроме того, эти мутанты хуже избегали воздействия макрофагов линии THP-1 и формировали менее выраженные биоплёнки. Полученные данные указывают на потенциальную эффективность выделенных фагов при лечении трудноизлечимых инфекций, связанных с биоплёнками E. faecalis.