Раскрытие механизма терапевтического действия травы эпимедиума при раке предстательной железы с помощью сетевой фармакологии и экспериментального подтверждения
Unveiling the therapeutic mechanism of Epimedium Herba on prostate cancer through network pharmacology and experimental validation
Аннотация
Трава эпимедиума обладает значительным терапевтическим потенциалом при раке предстательной железы (РПЖ), однако механизмы её действия изучены не полностью. В этом исследовании фармакологические механизмы действия травы эпимедиума при РПЖ изучали с помощью сетевой фармакологии и экспериментального подтверждения. Активные компоненты и потенциальные мишени определяли с помощью базы данных и платформы анализа фармакологии традиционной китайской медицины (TCMSP). Для построения сети взаимодействия белков (PPI) общих мишеней и выявления ключевых мишеней, связанных с противоопухолевым действием при РПЖ, использовали базу данных STRING. Экспрессию мРНК и белков ключевых генов-мишеней в нормальной ткани предстательной железы и ткани РПЖ, а также её связь с общей выживаемостью пациентов с РПЖ анализировали по данным баз The Cancer Genome Atlas (TCGA), Human Protein Atlas (HPA) и Gene Expression Profiling Interactive Analysis (GEPIA). Для потенциальных мишеней провели анализ обогащения по терминам Gene Ontology (GO) и путям Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG). Молекулярный докинг кверцетина с ключевыми мишенями TP53, TNF, HSP90AA1 (членом 1 класса A семейства белков теплового шока 90 альфа), AKT1, CASP3 и ESR1 выполнили с визуализацией результатов в PyMOL. Предсказания сетевой фармакологии проверили в экспериментах in vitro. Выявлено 23 активных компонента травы эпимедиума; пересечение потенциальных мишеней с мишенями РПЖ включало 183 потенциальные мишени. Анализ сети PPI выявил шесть ключевых генов-мишеней: TP53, TNF, HSP90AA1, AKT1, CASP3 и ESR1. Анализ обогащения GO выявил 2369 биологических процессов (BP), 77 клеточных компонентов (CC) и 215 молекулярных функций (MF). Анализ обогащения путей KEGG показал, что противоопухолевое действие травы эпимедиума связано с путями интерлейкина-17 (IL-17), TNF, фосфатидилинозитол-3-киназы (PI3K)–AKT, апоптоза, p53, HIF-1, митоген-активируемой протеинкиназы (MAPK), ядерного фактора κB (NF-κB) и устойчивости к ингибиторам тирозинкиназы EGFR. Проверка ключевых мишеней подтвердила согласованность результатов исследования. Молекулярный докинг показал стабильное связывание кверцетина со всеми шестью ключевыми мишенями. Эксперименты in vitro подтвердили, что кверцетин подавляет пролиферацию и индуцирует апоптоз в клетках ACT-1. В этом исследовании потенциальные терапевтические мишени при РПЖ выявлены с помощью сетевой фармакологии и экспериментально подтверждены.
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.