Глобальный набор данных о видах диких птиц — хозяевах вирусов гриппа птиц с унифицированной таксономией для эпидемиологического надзора

Дикие птицы — важные природные резервуары вирусов гриппа птиц (ВГП) и играют центральную роль в их распространении по всему миру. Однако отсутствие стандартизированного глобального перечня видов диких птиц — хозяев ВГП ограничивало комплексный мониторинг и оценку связанных с этими вирусами рисков в рамках концепции «Единое здоровье». В этой работе создан набор данных о видах диких птиц — хозяевах ВГП с унифицированной таксономией. Он основан на 23 358 изолятах вирусов, выделенных от диких птиц и зарегистрированных в базе данных GISAID EpiFlu в 1973–2023 годах. Названия видов-хозяев систематически извлекали, проверяли и унифицировали, чтобы устранить расхождения в отчетности и согласовать таксономию записей. Набор включает 394 вида диких птиц из 26 отрядов; значительную часть разнообразия хозяев составляют гусеобразные и ржанкообразные. Уточняя глобальный спектр видов диких птиц — хозяев ВГП, этот набор данных создает основу для выявления хозяев, филогенетической аннотации и анализа с учетом экологических признаков. Данные представлены в форматах, пригодных для машинной обработки, что позволяет проводить воспроизводимые крупномасштабные исследования на уровне видов в области вирусологии, эпидемиологии и биоразнообразия.