Трёхмерные атласы целых органов и организма позволяют профилировать весь клеточный состав

Последние достижения в области просветления тканей и светолистовой флуоресцентной микроскопии позволили анализировать целые органы и организм на уровне отдельных клеток. Однако комплексных биоинформатических ресурсов, таких как оцифрованные карты всего клеточного состава, аналогичные данным секвенирования всего генома, пока мало. Представлен CUBIC Organ/Body Atlas — набор трёхмерных эталонных карт с разрешением до отдельной клетки для одиннадцати органов взрослых мышей и всего тела новорождённой мыши. Для создания атласа оптимизированы протоколы просветления тканей и разработана система визуализации exMOVIE, обеспечивающая достаточное рабочее расстояние и осевое разрешение для трёхмерной визуализации органов и всего тела с последующим выявлением ядер клеток. Атлас позволяет сопоставлять несколько образцов на уровне отдельных клеток и может применяться для изучения развития органов, анализа патологических состояний и профилирования иммунных клеток во всём организме с помощью трёхмерного иммунного окрашивания. Таким образом, CUBIC Organ/Body Atlas способствует созданию единого рабочего процесса для анализа клеточного состава и углубляет системное понимание физиологических, developmentalных и патологических процессов в организме.