Вода — незаменимая жидкость в биофизике: от исследования сложной природы молекулярных взаимодействий до свойств гидратации наноматериалов, белков и мембран и молекулярных признаков гидрофобности
Water: The Essential Liquid in Biophysics : From the Scrutiny of the Complex Nature of its Molecular Interactions to the Hydration Properties of Nanomaterials, Proteins and Membranes, and the Fingerprints of Hydrophobicity
Аннотация
Простота молекулярной формулы воды не мешает ей проявлять сложные свойства, особенно выраженные при гидратации и в условиях наноконфайнмента, характерных для биологических интерфейсов. В этой главе мы рассматриваем молекулярные основы гидратации мембран, уделяя внимание фундаментальному принципу: взаимосвязи локальной структуры и энергии, определяющей двойственную природу взаимодействий воды. Мы вводим Vindex — не требующий параметрической подгонки структурный показатель, основанный на энергии и позволяющий различать тетраэдрическую координацию и дефекты водородных связей — два предпочтительных локальных состояния воды. С помощью этого показателя мы впервые даём однозначное, не основанное на произвольных допущениях молекулярное определение гидрофобности: «гидрофобность — это неспособность системы компенсировать дефекты водородных связей в гидратном слое с теми же энергетическими затратами, что и у объёмной воды (около −6 кДж/моль — всего примерно 30% энергии типичной водородной связи)». Эта абсолютная шкала устраняет субъективность понятия гидрофобности, точно выявляет переход при краевом угле θ = 90° и предсказывает режимы высыхания в наноконфайнменте. Применяя эти концепции в биофизике, мы показываем, что в гидратных оболочках белков и липидных мембран координационных дефектов значительно больше, чем в объёмной воде. Эти молекулы с дефектной структурой распределены не случайным образом, а концентрируются в функциональных областях, например в участках связывания белков. Наконец, мы приводим предварительные результаты, показывающие, что обогащение дефектами характерно и для гидратного слоя липидных мембран. Это позволяет с высоким пространственным разрешением, вплоть до отдельного атома, картировать локальную гидрофобность и углубить понимание молекулярного распознавания и проницаемости мембран. 4S
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.