Перманганат калия и хлорид тетраэтиламмония — безопасная и эффективная замена тетраоксиду осмия при твердофазном флуоресцентном химическом расщеплении неспаренных оснований

Хотя метод химического расщепления неспаренных оснований (CCM) позволяет выявлять все точечные мутации в ДНК, его широкое применение ограничивают сложная многоэтапная методика и необходимость использовать токсичные реагенты, в частности тетраоксид осмия. Мы показали, что тетраоксид осмия можно заменить перманганатом калия: он выявляет тот же спектр мутаций, но с большей чувствительностью. Перманганат калия совместим с твердофазным захватом и флуоресцентной детекцией, что делает выявление мутаций более безопасным. Мы сравнили CCM с использованием тетраоксида осмия и перманганата калия на полном наборе однонуклеотидных несовпадений, а также на нескольких вариантах небольших вставок и делеций.