Мониторинг профилей экспрессии около 7000 генов арабидопсиса при обработке абсцизовой кислотой с помощью микроматрицы полноразмерных кДНК

Полноразмерные кДНК необходимы для функционального анализа генов растений. Для количественной оценки глобальных профилей экспрессии генов и одновременного анализа их изменений недавно стали применять микроматрицы кДНК. Эта технология позволяет выявлять гены, экспрессия которых индуцируется воздействием окружающей среды или стрессом, и анализировать изменения их экспрессии в ответ на внешние сигналы. Мы создали микроматрицу полноразмерных кДНК арабидопсиса, включавшую около 7000 независимых групп полноразмерных кДНК, и проанализировали профили экспрессии генов. После обработки абсцизовой кислотой (АБК), засухи, холода и солевого стресса уровни транскриптов 245, 299, 54 и 213 генов соответственно повысились более чем в пять раз по сравнению с контролем. Анализ микроматрицы кДНК показал, что многие гены, индуцируемые АБК, активировались также при засухе и высоком засолении; перекрёстное взаимодействие ответов на засуху и АБК было выражено сильнее, чем взаимодействие ответов на АБК и холод. Среди выявленных генов, индуцируемых АБК, были 22 гена факторов транскрипции, что указывает на наличие множества механизмов регуляции транскрипции в путях передачи сигнала АБК.