Система делеционных бинов на основе микросателлитов для установления соответствий между генетической и физической картами пшеницы мягкой (Triticum aestivum L.)

Из-за полиплоидности и большого размера генома делеционные линии мягкой пшеницы служат идеальным материалом для физического картирования экспрессируемых последовательностей (EST) и генов в небольших хромосомных областях. Чтобы расширить возможности делеционных линий для картирования хромосомных бинов, с помощью 725 микросателлитных маркеров исследовали 84 линии, охватывающие все 21 хромосому пшеницы. Локусы микросателлитов удалось локализовать относительно 94 точек разрыва при гомозиготных делециях (88 дистальных и 6 интерстициальных) и пяти точек разрыва при гетерозиготных делециях; всего они соответствовали 159 делеционным бинам. Наиболее полно были охвачены хромосомы гомеологичных групп 2 и 5 (126 и 125 микросателлитных маркеров соответственно), наименее полно — группа 4 (80 маркеров). Как минимум один микросателлитный маркер был выявлен в 92% бинов; в среднем на бин приходилось 4,97 маркера SSR. Обнаружено лишь несколько расхождений в порядке расположения маркеров. Цитогенетические карты показали, что вблизи центромер большим физическим участкам соответствуют небольшие генетические расстояния, тогда как около теломер отношение генетического расстояния к физическому велико. Поскольку SSR-маркеры широко используют в генетических и селекционных исследованиях, нанесённые на карту локусы микросателлитов пригодятся не только для проверки делеционных линий, но и для отнесения ассоциированных с признаками количественных локусов (QTL) к делеционным бинам, где уже картировано множество EST, потенциально соответствующих генам-кандидатам.