Простой регрессионный метод картирования локусов количественных признаков в скрещиваниях инбредных линий с использованием фланкирующих маркеров

Использование методов с фланкирующими маркерами доказало свою эффективность при картировании локусов количественных признаков (QTL) в сегрегирующих поколениях, полученных при скрещивании инбредных линий. Для анализа таких данных разработаны методы максимального правдоподобия, позволяющие в некоторых случаях получить точные оценки эффектов QTL. Однако эти методы относительно сложны и могут требовать значительных вычислительных затрат. В этой работе мы разрабатываем методы картирования QTL на основе множественной регрессии, которые можно применять в любом универсальном статистическом пакете. На примере картирования в популяции F(2) показано, что результаты этих методов практически не отличаются от полученных методом максимального правдоподобия. Относительная простота регрессионных методов позволяет исследовать модели с несколькими QTL; мы приводим примеры двух сцепленных локусов и двух взаимодействующих локусов. Аналогичным образом можно подбирать и другие модели: например, с более чем двумя QTL, с фиксированными эффектами среды, межсемейной дисперсией или пороговыми признаками. Простота и быстрота применения, универсальность регрессионных методов анализа фланкирующих маркеров, а также точность получаемых оценок позволяют считать их предпочтительным методом анализа данных картирования QTL при скрещивании инбредных линий.