Идентификация видов с помощью ДНК-«штрихкодов»

Традиционные методы судебно-экспертной идентификации видов в основном основаны на иммунологических процедурах, применение которых ограничено при исследовании старых и деградировавших образцов. Среди молекулярных методов в судебной экспертизе используют последовательность гена митохондриального цитохрома b. Недавние таксономические исследования показали, что система идентификации на основе ДНК может способствовать уточнению видового разнообразия и классификации животных посредством анализа последовательностей и филогенетических связей. Определённые последовательности генов можно рассматривать как генетический «штрихкод», присутствующий в каждой клетке; ДНК-штрихкодирование представляет собой стандартизированный подход к характеристике видов с использованием коротких последовательностей ДНК в качестве диагностического биомаркера организмов. Целью настоящего исследования была оценка потенциала митохондриальных генов-«штрихкодов», таких как ген субъединицы 1 цитохром-c-оксидазы (COI) и ген 16S рРНК, в качестве инструмента судебной экспертизы. Мы разработали новый подход к видовой диагностике и идентификации с помощью одноплексной ПЦР, который будет полезен не только при расследовании уголовных дел, но и для обеспечения биологической безопасности, подтверждения подлинности пищевых продуктов, расследования случаев браконьерства и незаконной торговли видами, находящимися под угрозой исчезновения, а также для охраны дикой природы. Из генов COI и 16S рРНК были отобраны семь фрагментов длиной от 157 до 541 п. н. у человека с использованием различных переработанных наборов праймеров, пригодных для судебно-экспертных задач. Специфичность каждой пары праймеров оценивали в отдельных ПЦР-реакциях на различных субстратах, а показатели разнообразия рассчитывали с помощью статистических тестов, чтобы выбрать набор маркеров, пригодных для различных экспертных задач. Также представлен пример судебно-экспертной идентификации вида.