Изменения состава фекальной микробиоты человека после бактериотерапии рецидивирующей диареи, ассоциированной с Clostridium difficile

Диарея и колит, ассоциированные с Clostridium difficile (CDAD), — наиболее частые известные проявления антибиотик-ассоциированной диареи; предполагается, что заболевание обусловлено стойким нарушением состава нормальной кишечной микробиоты. Для лечения рецидивирующей CDAD можно применять бактериотерапию посредством трансплантации фекальной микробиоты, которая, как считается, восстанавливает нормальную микрофлору толстой кишки. Однако до недавнего времени ограничения традиционных микробиологических методов не позволяли проверить эту гипотезу. В настоящем исследовании с помощью методов полиморфизма длины терминальных рестрикционных фрагментов и секвенирования генов 16S рРНК охарактеризован состав бактерий микрофлоры толстой кишки у пациента с рецидивирующей CDAD до и после трансплантации фекальной микробиоты от здорового донора. До лечения остаточная микробиота толстой кишки пациента характеризовалась дефицитом представителей типов Firmicutes и Bacteroidetes, однако трансплантация оказала выраженное влияние на состав кишечной микробиоты. Через 14 дней после трансплантации состав фекальной микробиоты реципиента был чрезвычайно схож с микробиотой донора; в нём преобладали штаммы рода Bacteroides и неидентифицированная бактерия, продуцирующая бутират. Изменение состава бактерий сопровождалось исчезновением симптомов заболевания. Поразительное сходство кишечной микробиоты реципиента и донора после бактериотерапии позволяет предположить, что бактерии донора быстро заняли соответствующие экологические ниши, восстановив структуру и функции микробных сообществ.