Черепаха и заяц II: относительная информативность 21 некодирующей последовательности хлоропластной ДНК для филогенетического анализа

Последовательности хлоропластной ДНК служат одним из основных источников данных для молекулярно-систематических исследований растений. Несколько ключевых публикаций снабдили специалистов по молекулярной систематике универсальными парами праймеров для некодирующих участков, которые стали доминирующими в этой области, а именно для участков trnL-trnF и trnK/matK. Эти два участка обеспечивают достаточную информативность для установления родственных связей между видами у некоторых таксонов, однако на низких таксономических уровнях часто дают мало разрешающей способности. Для повышения разрешающей способности филогенетического анализа данные по этим участкам часто объединяют с данными по другим последовательностям. Выбор подходящего участка хлоропластной ДНК для филогенетического исследования затруднён недостатком сведений о темпах эволюции различных некодирующих участков хлоропластной ДНК. Целью настоящего исследования было определить, существует ли предсказуемая неоднородность скоростей эволюции среди 21 некодирующего участка хлоропластной ДНК, признанного филогенетически информативным на низких таксономических уровнях. Для оценки неоднородности скоростей эволюции в разных участках хлоропластной ДНК использовали по три вида из каждой из 10 групп, представляющих восемь основных филогенетических линий семенных растений. Результаты однозначно показывают, что исследование всего трёх репрезентативных таксонов позволяет прогнозировать объём филогенетической информации, который может предоставить участок хлоропластной ДНК, а также что скорости эволюции различных некодирующих участков хлоропластной ДНК неодинаковы.