Аллельный спектр болезни Шарко—Мари—Тута у более чем 17 000 пациентов с нейропатией

Представлены данные о частоте выявления, доле положительных результатов и типах мутаций в 14 генах (PMP22, GJB1, MPZ, MFN2, SH3TC2, GDAP1, NEFL, LITAF, GARS, HSPB1, FIG4, EGR2, PRX и RAB7A), связанных с болезнью Шарко—Мари—Тута (ШМТ), в когорте из 17 880 пациентов, направленных в коммерческую лабораторию генетического тестирования. Проанализированы обезличенные результаты секвенирования и мультиплексной лигазозависимой амплификации зондов (MLPA): 100 102 исследования методом секвенирования по Сэнгеру, 2338 исследований методом секвенирования нового поколения (NGS) и 21 990 исследований методом MLPA. Генетические нарушения выявлены у 18,5% пациентов (n = 3312). По результатам исследований методом секвенирования по Сэнгеру и MLPA (n = 3216), большинство положительных находок составляли дупликации (56,7%) или делеции (21,9%) гена PMP22, за которыми следовали мутации в генах GJB1 (6,7%), MPZ (5,3%) и MFN2 (4,3%). Делеции GJB1 и мутации в остальных генах объясняли 5,3% генетических нарушений. Патогенные мутации распределялись следующим образом: миссенс-мутации — 70,6%, нонсенс-мутации — 14,3%, мутации со сдвигом рамки считывания — 8,7%, мутации сайтов сплайсинга — 3,3%, делеции и вставки без сдвига рамки считывания — 1,8%, мутации стартового кодона — 0,8%, варианты с утратой стоп-кодона — 0,5%. Частота мутаций, доля положительных результатов и типы мутаций были сходными при исследовании методом секвенирования по Сэнгеру (n = 17 377) и методом NGS (n = 503). Среди пациентов с положительной находкой в гене, связанном с ШМТ, у 94,9% она выявлялась в одном из четырёх генов: PMP22, GJB1, MPZ или MFN2.