К новой многолокусной филогенетической таксономии дерматофитов

Были секвенированы типовые и референсные штаммы представителей семейства Arthrodermataceae порядка Onygenales по участкам рДНК ITS и частичного LSU, гену рибосомного белка 60S, а также фрагментам β-тубулина и фактора элонгации трансляции 3. Полученные филогенетические деревья в значительной степени совпадали между собой, а их топология соответствовала ранее опубликованным филогенетическим построениям, что свидетельствует о достижении приемлемого уровня стабильности филогенетической структуры дерматофитов и дерматофитоподобных грибов. Во всех деревьях род Trichophyton оказался полифилетичным. В предлагаемой классификации Trichophyton ограничен преимущественно производной кладой; в результате почти все антропофильные дерматофиты отнесены к родам Trichophyton и Epidermophyton, наряду с некоторыми зоофильными видами, регулярно инфицирующими человека. Род Microsporum ограничен несколькими видами, родственными M. canis, тогда как геофильные виды и зоофильные виды, менее связанные с человеком, распределены между родами Arthroderma, Lophophyton и Nannizzia. Для Keratinomyces ceretanicus предложен новый род Guarromyces. Предложено 13 новых номенклатурных комбинаций; обзор всех описанных видов показал, что наибольшее число новых таксономических решений было принято в 1920–1940-е годы, когда наряду с клиническими признаками использовали морфологические характеристики. При необходимости для видов устанавливали неотипы или эпитипы; это потребовалось для Arthroderma curreyi, Epidermophyton floccosum, Lophophyton gallinae, Trichophyton equinum, T. mentagrophytes, T. quinckeanum, T. schoenleinii, T. soudanense и T. verrucosum. В предлагаемой таксономии род Trichophyton включает 16 видов, Epidermophyton — 1 вид, Nannizzia — 9 видов, Microsporum — 3 вида, Lophophyton — 1 вид, Arthroderma — 21 вид, а Ctenomyces — 1 вид; однако для установления границ видов необходимы более детальные исследования. Каждый вид теперь имеет одно валидное название. Вводятся два новых рода: Guarromyces и Paraphyton. Число родов увеличилось, однако виды, имеющие значение для рутинной диагностики, теперь относятся к меньшим по объёму группам, что облегчает их идентификацию.