Колонизация, инфекция и вспомогательный геном Klebsiella pneumoniae

Кlebsiella pneumoniae — грамотрицательный патоген с обширным вспомогательным геномом, включающим плазмиды и хромосомные локусы генов. Этот вспомогательный геном разделяет штаммы на оппортунистические, гипервирулентные и мультирезистентные группы и отличает их от двух близкородственных видов — Klebsiella variicola и Klebsiella quasipneumoniae. Некоторые штаммы K. pneumoniae действуют как оппортунистические патогены, вызывая инфекции у пациентов в критическом состоянии и у иммунокомпрометированных больных. Они являются частой причиной внутрибольничных инфекций, включая пневмонию, инфекции мочевых путей и инфекции кровотока. Штаммы K. variicola и K. quasipneumoniae часто клинически неотличимы от оппортунистических штаммов K. pneumoniae. Другие штаммы K. pneumoniae обладают гипервирулентностью, инфицируют здоровых людей в условиях сообщества и вызывают тяжелые инфекции, включая гнойный абсцесс печени, эндофтальмит и менингит. Третья группа штаммов кодирует карбапенемазы, что делает их высокорезистентными к антибиотикам. Эти штаммы ведут себя как оппортунистические, но крайне трудно поддаются лечению. Все эти группы K. pneumoniae и родственные виды способны колонизировать желудочно-кишечный тракт, и вспомогательный геном может определять, останется ли колонизирующий штамм бессимптомным или перейдет в заболевание. В этом обзоре рассматриваются связи между колонизацией и инфекцией при оппортунистических, антибиотикорезистентных и гипервирулентных штаммах, а также роль вспомогательного генома в различении этих групп и родственных видов. По мере того как инфекции становятся все труднее лечить на фоне антибиотикорезистентности и появления гипервирулентных штаммов, углубление понимания эпидемиологии и патогенеза этих бактерий приобретает принципиальное значение.