Сравнительный анализ транскриптома и метаболомного профиля четырех тканей Alisma orientale (Sam.) Juzep выявляет особенности развития соцветий и лекарственного состава растения

Alisma orientale (Sam.) Juzep (A. orientale) — важное лекарственное растение традиционной китайской медицины. В этом исследовании провели анализ транскриптома A. orientale de novo на основе библиотек кДНК, полученных из четырех типов тканей: корней, листьев, цветоносов и соцветий. Всего было собрано 41 685 унигенов; функциональную аннотацию получили для 25 024 унигенов, сопоставив их с пятью общедоступными базами последовательностей. Впервые для A. orientale описали 3411 простых последовательностных повторов (SSR). Проанализировали 15 402 дифференциально экспрессирующихся гена. При изучении морфологических характеристик установили, что листья содержат больше хлорофилла, цветоносы — больше сосудистых пучков, а соцветия — больше крахмальных гранул и белка, чем другие ткани. Кроме того, методом ультраэффективной жидкостной хроматографии с тандемной масс-спектрометрией с тройным квадруполем определили содержание восьми алисолов. Основными компонентами во всех четырех тканях были алисол B 23-ацетат и алисол B; их содержание составляло соответственно 0,068–0,350 и 0,046–0,587 мг/г. Результаты количественной ПЦР с обратной транскрипцией подтвердили, что фарнезилпирофосфатсинтазу и 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-редуктазу следует рассматривать как ключевые гены-кандидаты, участвующие в биосинтезе алисолов. Полученные транскриптомные и метаболомные профили A. orientale могут помочь раскрыть молекулярные механизмы, лежащие в основе лекарственных свойств этого растения.