Локальная таксономическая характеристика микобиома зубного налёта выявляет выраженные изменения состава грибкового сообщества при прогрессировании кариеса раннего детского возраста

Кариес — одно из самых распространённых заболеваний в мире. Бактерии и грибы являются комменсалами полости рта, однако большинство исследований кариеса посвящено влиянию бактерий. Грибковое сообщество полости рта, связанное с кариесом, изучено недостаточно, а его роль в развитии заболевания неясна. Для определения таксономического состава использовали секвенирование ампликонов ITS1 в образцах наддесневого зубного налёта, взятых с отдельных участков (n = 82) у 33 детей с различным статусом кариеса. Дети были свободны от кариеса (CF), имели активный кариес с поражением эмали (CAE) или активный кариес с поражением дентина (CA). Образцы налёта брали с поверхностей без кариеса (PF), а также из очагов поражения эмали (PE) и дентина (PD). Для характеристики микобиома и его изменений по мере прогрессирования заболевания использовали таксономические профили, соответствующие категориям CF-PF, CAE-PF, CAE-PE, CA-PF, CA-PE и CA-PD. Всего выявили 139 видов грибов. Наиболее распространённым видом была Candida albicans, за ней следовала Candida dubliniensis. Сообщества налёта при выраженном прогрессировании заболевания (CA-PD) достоверно отличались от сообществ здорового налёта (CF-PF). В разных категориях образцов налёта обнаружили 32 таксона с различной представленностью. Candida albicans, Candida dubliniensis, Nigrospora oryzae, Microdochium и неидентифицированный вид были связаны с кариесом, тогда как 12 других таксонов ассоциировались со здоровьем. Представленность Candida dubliniensis последовательно возрастала по мере прогрессирования кариеса, что позволяет предположить её возможную роль в патогенезе заболевания. Напротив, четыре вида грибов, связанных со здоровьем, потенциально способны подавлять Streptococcus mutans за счёт продукции ксилита, что может быть одним из механизмов поддержания здоровья зубов.

Значимость: Кариес раннего детского возраста — одно из наиболее распространённых заболеваний у детей во всём мире; его можно предотвратить, однако он остаётся глобальной проблемой общественного здравоохранения. Нелеченые кариозные полости вызывают боль, требуют значительных затрат и могут привести к потере зубов и снижению качества жизни. Кариес развивается вследствие выработки кислот при ферментации пищевых углеводов микроорганизмами, что приводит к эрозии эмали. Несмотря на то что кариес хорошо изучен, большинство исследований посвящено влиянию бактерий, хотя грибы также являются комменсалами зубного налёта. О влиянии грибов на патогенез кариеса известно очень мало. Выявление грибковых таксонов, участвующих в прогрессировании кариеса, необходимо для более полного понимания микробиома полости рта. Результаты этого исследования помогут понять, как меняется грибковое сообщество по мере прогрессирования заболевания, и лучше разобраться в сложной этиологии кариеса, что необходимо для разработки планов лечения и профилактических мер.