Предварительное выявление потенциальных вакцинных мишеней для коронавируса COVID-19 (SARS-CoV-2) на основе иммунологических исследований SARS-CoV

В начале 2020 года возникла вспышка COVID-19, вызванная новым коронавирусом Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Существует неотложная потребность лучше понять этот новый вирус и разработать способы контроля его распространения. В этом исследовании мы стремились получить данные для разработки вакцины против SARS-CoV-2, учитывая высокое генетическое сходство между SARS-CoV-2 и SARS-CoV, вызвавшим вспышку в 2003 году, и используя имеющиеся иммунологические исследования SARS-CoV. Путём скрининга экспериментально определённых В-клеточных и Т-клеточных эпитопов SARS-CoV, происходящих из иммуногенных структурных белков SARS-CoV, мы выявили набор В-клеточных и Т-клеточных эпитопов, происходящих из белков шипа (S) и нуклеокапсида (N), которые полностью совпадают с белками SARS-CoV-2. Поскольку среди 120 доступных последовательностей SARS-CoV-2 (по состоянию на 21 февраля 2020 года) в этих эпитопах не было обнаружено ни одной мутации, иммунное нацеливание на эти эпитопы потенциально может обеспечить защиту от этого нового вируса. Для Т-клеточных эпитопов мы выполнили анализ популяционного покрытия соответствующих аллелей ГКГС и предложили набор эпитопов, который, по оценке, обеспечивает широкое покрытие в глобальном масштабе, а также в Китае. Наши результаты предоставляют отобранный набор эпитопов, который может помочь направить экспериментальные усилия на разработку вакцин против SARS-CoV-2.