Снижение перекрёстной консервативности Т-клеточных эпитопов и иммуногенного потенциала связано с появлением доминирующей подкладки K вируса гриппа в 2025 году

Подкладка K — новый вариант вируса гриппа A/H3N2, который стал доминирующим штаммом в глобальной циркуляции; в 2025–2026 годах более 90% случаев гриппа A были связаны с подкладкой K. Хотя сезонные вакцины вызывали измеримый перекрёстно-реактивный ответ антител с ингибированием гемагглютинации и нейтрализующие антитела к новому штамму считались защитными, Т-клетки вносят существенный вклад в защиту от инфицирования и тяжёлого течения болезни. Т-клеточные эпитопы, консервативные между вакцинными и циркулирующими штаммами, могут оказывать защитное действие. Мы предположили, что мутации антигена HA, возникающие в ходе эволюции вируса, приводят к утрате части перекрёстно консервативных Т-клеточных эпитопов и что эта утрата могла способствовать появлению подкладки K. С помощью нового инструмента иммуноинформатики EpiCC мы оценили перекрёстную консервативность Т-клеточных эпитопов между подкладкой K, другими циркулирующими штаммами H3N2 и самыми недавними сезонными вакцинными штаммами. Анализ 706 последовательностей HA H3N2 показал 10%-ное снижение содержания перекрёстно консервативных Т-клеточных эпитопов между сезонными вакцинами, циркулирующими штаммами и подкладкой K. Снижение перекрёстной консервативности может сигнализировать о появлении новых штаммов гриппа. Прогностический анализ перекрёстно консервативных Т-клеточных эпитопов может улучшить выбор вакцин. Утрата Т-клеточных эпитопов также может снизить эффективность новых вакцин против гриппа для подкладки K осенью 2026 года.