Эпизодические всплески синонимичного расхождения внутри генома и между видами, смещённые в сторону гуанина и цитозина, в митогеномах подсемейства Живучковые (Lamiaceae)

Скорости синонимичных замен в митохондриальных геномах растений различаются между видами на несколько порядков, тогда как скорости синонимичных замен у разных генов внутри одного генома обычно схожи. Исключение представляет митохондриальный геном Ajuga reptans (Lamiaceae), в котором выявлена беспрецедентная внутригемная неоднородность синонимичного расхождения последовательностей; биологические механизмы такой вариабельности скоростей остаются неясными. Проследив возникновение и эволюционную динамику вариаций скоростей митохондриальных замен на основе детального отбора представителей подсемейства Живучковые, мы обнаружили различия во времени и степени ускорения для отдельных генов. Наиболее дивергировавшие гены ускоряли эволюцию раньше, сохраняли высокую скорость на протяжении всего подсемейства и, как правило, не подвергались редактированию РНК, тогда как у генов с умеренным расхождением ускорение начиналось позже, а частота редактирования РНК оставалась относительно высокой. Ускорение скоростей мутаций коррелировало с повышением содержания гуанина и цитозина, что указывает на важную роль генной конверсии со смещением в сторону GC и/или репарации после разрушения предковых кластеров генов.