Динамика вирусной нагрузки, продолжительность выделения вируса и заразность SARS-CoV-2, SARS-CoV и MERS-CoV: систематический обзор и метаанализ

Введение: Кинетика вирусной нагрузки и продолжительность выделения вируса — важные факторы передачи инфекции. Мы стремились охарактеризовать динамику вирусной нагрузки, продолжительность выделения вирусной РНК и выделения жизнеспособного вируса SARS-CoV-2 в различных биологических жидкостях, а также сравнить динамику вирусной нагрузки SARS-CoV-2, SARS-CoV и коронавируса ближневосточного респираторного синдрома (MERS-CoV).

Методы: В этом систематическом обзоре и метаанализе мы провели поиск в базах данных, включая MEDLINE, Embase, Europe PubMed Central и серую литературу, по научным публикациям, вышедшим с 1 января 2003 года по 6 июня 2020 года. В анализ включали серии случаев (не менее пяти участников), когортные исследования и рандомизированные контролируемые исследования, в которых сообщалось об инфекции SARS-CoV-2, SARS-CoV или MERS-CoV и оценивались кинетика вирусной нагрузки, продолжительность выделения вируса или наличие жизнеспособного вируса. Два автора независимо извлекали данные из опубликованных исследований либо связывались с авторами для их получения, а также оценивали качество исследований и риск систематической ошибки с помощью инструментов критической оценки Joanna Briggs Institute. Для каждого включённого исследования рассчитывали среднюю продолжительность выделения вируса и 95% ДИ, затем применяли модель случайных эффектов для оценки объединённого размера эффекта. С помощью взвешенного метарегрессионного анализа с моделью максимального правдоподобия без ограничений оценивали влияние потенциальных модераторов на объединённый размер эффекта. Исследование зарегистрировано в PROSPERO: CRD42020181914. Поиск также проводили в medRxiv и bioRxiv.

Результаты: В анализ включили 79 исследований SARS-CoV-2 (5340 участников), 8 исследований SARS-CoV (1858 участников) и 11 исследований MERS-CoV (799 участников). Средняя продолжительность выделения РНК SARS-CoV-2 составляла 17,0 дня (95% ДИ 15,5–18,6; 43 исследования, 3229 участников) из верхних дыхательных путей, 14,6 дня (9,3–20,0; 7 исследований, 260 участников) из нижних дыхательных путей, 17,2 дня (14,4–20,1; 13 исследований, 586 участников) с калом и 16,6 дня (3,6–29,7; 2 исследования, 108 участников) в образцах сыворотки. Максимальная продолжительность выделения составляла 83 дня из верхних дыхательных путей, 59 дней из нижних дыхательных путей, 126 дней с калом и 60 дней в сыворотке. Объединённая средняя продолжительность выделения SARS-CoV-2 положительно ассоциировалась с возрастом (коэффициент наклона 0,304 [95% ДИ 0,115–0,493]; p=0,0016). Ни в одном исследовании жизнеспособный вирус не выявлялся после 9-го дня болезни, несмотря на сохраняющуюся высокую вирусную нагрузку, о которой судили по значениям порога цикла. Вирусная нагрузка SARS-CoV-2 в верхних дыхательных путях, по-видимому, достигала максимума в течение первой недели болезни, тогда как для SARS-CoV пик приходился на 10–14-й дни, а для MERS-CoV — на 7–10-й дни.

Выводы: Хотя выделение РНК SARS-CoV-2 с респираторными выделениями и калом может продолжаться длительное время, период выделения жизнеспособного вируса относительно короток. Титры SARS-CoV-2 в верхних дыхательных путях достигают максимума в течение первой недели болезни. Раннее выявление случаев и изоляция, а также информирование населения о спектре проявлений болезни и периоде заразности имеют ключевое значение для эффективного сдерживания распространения SARS-CoV-2.

Финансирование: отсутствовало.