Геномный поиск сигнатур отбора выявил кандидатные гены адаптации и продуктивных признаков у различных пород крупного рогатого скота

Одомашнивание и отбор являются основными факторами, определяющими генетическую изменчивость сельскохозяйственных животных. Эти процессы формируют в геноме уникальные сигнатуры отбора. В настоящем исследовании проанализированы данные, полученные с использованием чипа BovineSNP50, для 236 животных семи пород зебу и пяти тауринских пород крупного рогатого скота. Для выявления сигнатур отбора применили три взаимодополняющих подхода: интегрированную оценку гаплотипов (iHS), анализ протяжённых участков гомозиготности (ROH) и метод F. С помощью методов iHS, ROH и F выявлены соответственно 179, 56 и 231 участок, содержащие 518, 277 и 267 кандидатных генов. Обнаружено несколько кандидатных генов, включая NCR3, ARID5A, HIST1H2BN, DEFB4, DEFB7, HSPA1L, HSPA1B и DNAJB4, связанных с продуктивными признаками и адаптацией аборигенных пород к местным неблагоприятным факторам среды, таким как тепловой стресс и восприимчивость к заболеваниям. Для уточнения полученных результатов необходимы дальнейшие исследования с большим объёмом выборки, полногеномным секвенированием и/или генотипированием высокой плотности. STST