Повышенное связывание спайкового белка SARS-CoV-2 с мутацией N501Y с рецептором ACE2 человека: данные молекулярно-динамического моделирования
Enhanced binding of the N501Y-mutated SARS-CoV-2 spike protein to the human ACE2 receptor: insights from molecular dynamics simulations
Аннотация
Недавно появились варианты SARS-CoV-2 (B.1.1.7 и B.1351), содержащие мутации, повышающие их контагиозность. Мутация N501Y в рецептор-связывающем домене (RBD) спайкового белка этих вариантов SARS-CoV-2 может усиливать связывание с ангиотензинпревращающим ферментом 2 человека (hACE2). Однако до сих пор не было предложено молекулярного объяснения такого повышения аффинности. С использованием полноатомного молекулярно-динамического моделирования мы показали, что остаток Y501 в мутировавшем RBD может посредством гидрофобных взаимодействий образовывать устойчивые контакты с остатками Y41 и K353 в hACE2, что может повысить общую аффинность связывания RBD с hACE2 примерно на 0,81 ккал·моль⁻¹. Выявленная в исследовании динамика связывания может служить рабочей моделью для разработки более эффективных антител.
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.