Полная карта мутаций RBD SARS-CoV-2, обеспечивающих ускользание от моноклонального антитела LY-CoV555 и его комбинации с LY-CoV016

Моноклональные антитела и коктейли антител представляют собой перспективные средства лечения и профилактики коронавирусной инфекции 2019 года (COVID-19). Однако продолжающаяся эволюция вируса тяжёлого острого респираторного синдрома — коронавируса 2 (SARS-CoV-2) может сделать моноклональные антитела неэффективными. В этой работе составлена полная карта всех мутаций рецептор-связывающего домена (RBD) шиповидного белка SARS-CoV-2, препятствующих связыванию ведущего моноклонального антитела LY-CoV555 и его комбинации с LY-CoV016. Отдельные мутации, обеспечивающие ускользание от каждого из антител, сочетаются в циркулирующих линиях SARS-CoV-2 B.1.351 и P.1: E484K препятствует связыванию LY-CoV555, а K417N/T — LY-CoV016. Кроме того, мутация L452R в линии B.1.429 препятствует связыванию LY-CoV555. Также выявлены одиночные аминокислотные замены, обеспечивающие ускользание от комбинированного коктейля LY-CoV555+LY-CoV016. Для повышения устойчивости антител и коктейлей антител к антигенной эволюции SARS-CoV-2 в будущих разработках следует использовать более разнообразные эпитопы.