Конструирование молекул de novo и генеративные модели

Стратегии молекулярного дизайна имеют принципиальное значение для развития лекарственной терапии. Компьютерные методы конструирования молекул de novo разрабатываются на протяжении последних трёх десятилетий; в последние годы, отчасти благодаря достижениям машинного обучения (ML) и искусственного интеллекта (AI), в области поиска и разработки лекарственных средств накоплен практический опыт их применения. В настоящем обзоре обобщён этот опыт и представлены методы конструирования de novo в зависимости от степени детализации представления молекулы: на основе атомов, фрагментов или химических реакций. Кроме того, подчёркивается значение надёжных сравнительных тестов, описываются основные проблемы практического применения этих методов и обозначаются перспективные направления исследований, а также задачи, которые предстоит решить в ближайшие годы.