Повторное возникновение делеции H69/V70 в шиповидном белке SARS-CoV-2 и её роль в варианте Alpha B.1.1.7

Мы сообщаем о выявлении делеции ΔH69/V70 в шиповидном белке SARS-CoV-2 в нескольких независимо возникших линиях; часто она появлялась после приобретения замен в рецептор-связывающем мотиве, таких как N439K и Y453F, которые, как известно, повышают сродство к рецептору ACE2 и обеспечивают ускользание от антител. В условиях in vitro мы показали, что сама по себе делеция ΔH69/V70 не обеспечивает ускользание от антител, но повышает инфекционность, что связано с усиленным включением расщепленного шиповидного белка в вирионы. Делеция ΔH69/V70 способна частично восстанавливать инфекционность вариантов шиповидного белка с мутациями ускользания N439K и Y453F за счёт усиленного включения шиповидного белка в вирионы. Кроме того, восстановление остатков H69 и V70 в шиповидном белке варианта Alpha B.1.1.7, в котором делеция ΔH69/V70 встречается естественным образом, снижает включение шиповидного белка в вирионы и эффективность проникновения псевдотипированного вируса с шиповидным белком B.1.1.7. Шиповидный белок варианта Alpha B.1.1.7 обеспечивает более быстрое слияние клеток по сравнению с диким типом Wuhan-1 D614G; этот эффект зависит от делеции ΔH69/V70. Таким образом, поскольку ΔH69/V70 компенсирует снижение инфекционности, обусловленное мутациями ускользания от иммунного ответа, необходим продолжительный мониторинг делеций, оказывающих функциональное влияние.