Антимикробные пептиды: современные представления о классификации и базах данных

Антимикробные пептиды обнаруживаются во всех царствах живой природы и являются важнейшим компонентом защитных механизмов организма. В основном это короткие катионные пептиды, обладающие большим разнообразием структур и мишеней. В связи с постоянно распространяющейся устойчивостью различных патогенов к существующим противомикробным препаратам антимикробные пептиды в последнее время привлекают значительное внимание как потенциальные терапевтические средства. По мере увеличения числа открытых антимикробных пептидов создаётся всё больше специализированных баз данных, предназначенных для сбора фундаментальной и фармакологической информации. В настоящем обзоре обобщены сведения об источниках, структуре, механизмах действия и классификации антимикробных пептидов. Кроме того, рассмотрены современные базы данных антимикробных пептидов, сопоставлены информативные вычислительные инструменты для прогнозирования антимикробной активности и механизмов действия, а также освещены новые подходы машинного обучения, которые можно использовать для повышения активности антимикробных пептидов в борьбе с глобальной устойчивостью к противомикробным препаратам.