Микробиота кишечника превосходит микробиоту шейки матки при ранней диагностике эндометриоза

Диагностика эндометриоза обычно запаздывает на несколько лет из-за неспецифических симптомов и травматичности диагностических методов. В нескольких исследованиях показано, что микробиота кишечника и цервикальная слизь потенциально могут служить дополнительными диагностическими биомаркерами. Однако ни в одном из предыдущих исследований не сравнивали надёжность классификаторов эндометриоза, основанных на микробиоте из разных участков тела, и не изучали взаимосвязь микробиоты кишечника, цервикальной слизи и перитонеальной жидкости для поиска альтернативных подходов к диагностике. В исследование включили 41 женщину (20 в контрольной группе и 21 с эндометриозом) и собрали 122 сопоставленных образца кала, цервикальной слизи и перитонеальной жидкости, чтобы изучить особенности микробиома у пациенток с эндометриозом. Состав микробиоты существенно различался в зависимости от участка тела; при этом 19 таксонов встречались во всех трёх участках. Кроме того, у пациенток с эндометриозом состав микробных сообществ отличался от такового в контрольной группе, особенно в образцах кала и перитонеальной жидкости: в перитонеальной жидкости была повышена представленность патогенов, а в кале — снижена представленность защитных микроорганизмов. В частности, роды Ruminococcus и Pseudomonas были определены как потенциальные биомаркеры соответственно в кишечнике и перитонеальной жидкости. На основе таксонов, отобранных с помощью устойчивого метода машинного обучения, были созданы новые классификаторы эндометриоза. Полученные результаты показали, что микробиота кишечника превосходит микробиоту цервикальной слизи при диагностике эндометриоза. В целом исследование позволяет лучше понять особенности микробиоты в разных участках тела при эндометриозе и подчёркивает потенциальную ценность микробиоты кишечника для ранней диагностики заболевания; роль микробиоты требует дальнейшего изучения.