WormBase в 2022 году: данные, процессы и инструменты для анализа Caenorhabditis elegans

WormBase (www.wormbase.org) — основной ресурс генетических и геномных данных о нематоде Caenorhabditis elegans. Мы предоставляем научному сообществу данные и инструменты, облегчающие использование C. elegans и родственных нематод в качестве модельных организмов для изучения здоровья человека, развития и многих аспектов фундаментальной биологии. За 22 года работы мы постоянно развивались, отражая прогресс науки и технологий, применяемых при изучении C. elegans. Мы стремимся включать новые типы данных и более полные наборы данных, а также предоставлять интегрированные средства визуализации и сервисы, дающие доступ к знаниям, накопленным в опубликованных исследованиях по генетике нематод. В этой статье представлен общий обзор современного состояния WormBase: типов данных, процессов курирования, аналитических возможностей и инструментов, включая новые возможности анализа данных отдельных клеток, извлечения информации из текстов и визуализации, а также новый форум для сотрудничества участников сообщества. Параллельно мы продолжаем интеграцию и согласование инфраструктуры, процессов и инструментов с Альянсом геномных ресурсов, одним из основателей которого является WormBase.