Обнаружение и характеристика нового умбра-подобного вируса — вируса земляники A, заражающего растения земляники

Новый РНК-вирус, заражающий растения земляники, обнаружен методом высокопроизводительного секвенирования. Исследованное растение одновременно было заражено тремя генетическими вариантами вируса, предварительно названного вирусом земляники A (StrVA). Хотя StrVA филогенетически группируется с несколькими недавно обнаруженными неклассифицированными вирусами растений, его геном меньше и имеет ряд уникальных особенностей организации. Разработана специфичная и чувствительная система количественной ПЦР для выявления обнаруженных генетических вариантов StrVA. Проведённое в Чехии исследование показало, что StrVA присутствовал в 28,3% образцов земляники (n = 651) различного происхождения: с плантаций, из садов и в посадочном материале. Секвенирование 48 случайно выбранных образцов земляники, положительных на StrVA, показало, что в 62,5% из них присутствовали два или все три генетических варианта StrVA в разных соотношениях. В 57,1% образцов StrVA выявляли при смешанной инфекции с другими вирусами — вирусом слабого пожелтения краёв листьев земляники, вирусом морщинистости земляники, вирусом крапчатости земляники, полеровирусом земляники 1 или вирусом земляники 1. Это затрудняло оценку биологической значимости StrVA и его влияния на состояние растений.