Руководство по анализу метаболомики: биоинформатический рабочий процесс

Метаболомика — развивающаяся область, позволяющая систематически количественно определять множество метаболитов. Основная цель метаболомики заключается в выявлении метаболитов, связанных с каждым биологическим фенотипом, с последующим анализом лежащих в основе механизмов. Хотя метаболомика важна для понимания происходящих биологических процессов, её возможности по их исчерпывающему описанию ограничены. Поэтому рекомендуется интегрированный анализ данных метаболомики, транскриптомики, протеомики и других омиксных подходов. Интеграция данных, полученных на разных омиксных уровнях, требует специализированного статистического и биоинформатического программного обеспечения. В этом обзоре рассматриваются этапы метаболомного исследования и обобщаются основные инструменты для анализа метаболомных данных. Кроме того, описаны наиболее выраженные нарушения метаболических путей при некоторых видах рака и заболеваниях, а также обсуждается значение алгоритмов интеграции мультиомных данных. В целом цель обзора — обобщить современный рабочий процесс анализа метаболомных данных и основные программные средства, чтобы помочь исследователям сформировать оптимальную схему метаболомного или мультиомного анализа.