Ключевая роль спектральных библиотек в сохранении знаний сообщества метаболомики

Введение: Поиск по спектральным библиотекам — наиболее распространённый подход к аннотированию соединений в нетаргетной метаболомике. За последнее десятилетие спектральные библиотеки для жидкостной хроматографии с масс-спектрометрией значительно выросли: теперь они включают от сотен тысяч до миллионов масс-спектров и десятки тысяч соединений, формируя важную базу знаний для интерпретации метаболомных экспериментов.

Цель обзора: Описать существующие ресурсы спектральных библиотек, выделить различные подходы к их формированию и обсудить критерии качества, которые необходимо учитывать при интерпретации результатов поиска. Кроме того, мы рассказываем, как спектральные библиотеки расширяют возможности инструментов машинного обучения нового поколения в вычислительной метаболомике, и обсуждаем перспективы использования крупных спектральных библиотек, доступ к которым становится всё проще.

Основные научные положения обзора: Обзор посвящён современному состоянию спектральных библиотек для нетаргетной метаболомики на основе LC-MS/MS. Мы показываем, что за последние восемь лет число записей в общедоступных спектральных библиотеках выросло более чем в 60 раз, способствуя молекулярной интерпретации данных, и обсуждаем, как в ближайшем будущем будет меняться роль спектральных библиотек в нетаргетной метаболомике.