Идентификация PFKFB2 как ключевого гена перехода от острого к давнему инфаркту миокарда по данным анализа периферической крови

Цель: Проанализировать профиль экспрессии генов в периферической крови на разных стадиях инфаркта миокарда (ИМ) методом транскриптомного секвенирования и изучить особенности экспрессии генов в периферической крови после ИМ.

Методы: Для выявления генов и модулей, ассоциированных с давним инфарктом миокарда (ДИМ), использовали анализ дифференциально экспрессируемых генов (DEG) и взвешенный анализ сетей коэкспрессии генов (WGCNA). Для изучения потенциальных функций генов применяли функциональную аннотацию по онтологии генов (GO) и аннотацию сигнальных путей по базе данных Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG). Ключевые гены выявляли с помощью классификатора на основе случайного леса. Метод CIBERSORT использовали для оценки содержания 22 типов иммунных клеток в периферической крови. Уровни экспрессии генов в клинических образцах определяли методом количественной полимеразной цепной реакции (qPCR). Клеточный состав периферической крови оценивали с помощью автоматического гематологического анализатора.

Результаты: В результате анализа дифференциальной экспрессии и сетей коэкспрессии были выявлены 11 генов-кандидатов. Классификатор на основе случайного леса определил 10 ключевых генов. С ДИМ коррелировало содержание покоящихся CD4+ Т-клеток памяти, покоящихся NK-клеток, активированных дендритных клеток, покоящихся тучных клеток, моноцитов и нейтрофилов в периферической крови. По данным корреляционного анализа Спирмена, PFKFB2 был связан с указанными иммунными клетками. В клинических образцах выявлена низкая экспрессия PFKFB2 в периферической крови пациентов с ДИМ; анализ взаимосвязи между экспрессией PFKFB2 и числом иммунных клеток периферической крови показал связь с содержанием моноцитов.

Выводы: При ДИМ экспрессия PFKFB2 снижена и связана с распределением иммунных клеток. PFKFB2 может играть ключевую роль в отражении перехода от острого инфаркта миокарда к давнему, а также в прогнозировании распределения иммунных клеток, что открывает новые возможности для изучения коррекции фиброза миокарда и неблагоприятного ремоделирования.