Исследование эфирных масел видов Achillea: от химического анализа до компьютерного моделирования связывания с главной протеазой SARS-CoV-2

В этом исследовании были идентифицированы и проанализированы фитохимические соединения, выделенные из трёх представителей рода Achillea, после чего оценено их взаимодействие с главной протеазой SARS-CoV-2. В частности, изучали противовирусный потенциал этих природных соединений в отношении главной протеазы SARS-CoV-2, а также их активность против главной протеазы SARS-CoV-1, использованной в качестве стандарта из-за её высокой структурной схожести с протеазой SARS-CoV-2. Эти ферменты играют ключевую роль в размножении вирусов в клетках человека. Для идентификации компонентов эфирных масел видов Achillea использовали газовую хроматографию с масс-спектрометрией (GC-MS). Для изучения действия фармакологически активных соединений на главные протеазы SARS-CoV-1 и SARS-CoV-2 применяли инструменты хемоинформатики, включая AutoDock 4.2.6, SwissADME, ProTox-II и LigPlot. Согласно значениям энергии связывания, ацетат кессанила, хавибетол (м-эвгенол), фарнезол и 7-эпи-β-эвдесмол локализовались в активном центре протеаз коронавирусов. Кроме того, было показано, что благодаря образованию водородных связей с аминокислотными остатками активных центров вирусных белков эти молекулы способны блокировать размножение SARS-CoV-2. Проведённые скрининг и компьютерный анализ позволили рассматривать указанные соединения для дальнейших доклинических исследований. Кроме того, с учётом их низкой токсичности полученные данные могут способствовать проведению новых исследований in vitro и in vivo этих природных ингибиторов главной протеазы SARS-CoV-2.