Полный пластидный геном и его характеристика у тысячелистника обыкновенного

Тысячелистник обыкновенный — лекарственное и декоративное растение. Его листья и цветки содержат ароматическое масло, а зрелую траву используют как потогонное средство и для облегчения ревматических болей. Растение выращивают в садах по всему Китаю. До настоящего времени наиболее полные данные о хлоропластных геномах Achillea относились к кладам Нового Света и использовались для выбора маркеров и филогенетических исследований. Мы полностью секвенировали хлоропластный геном тысячелистника обыкновенного. Согласно полученным данным, его пластидный геном имеет размер 149 078 п. н. и типичную четырёхчастную структуру, включающую один большой однокопийный участок (LSC) размером 82 352 п. н., один малый однокопийный участок (SSC) размером 18 426 п. н. и пару инвертированных повторов (IR) размером по 24 150 п. н. Хлоропластный геном содержит стандартный набор генов: 88 генов, кодирующих белки, 37 генов транспортных РНК и 8 генов рибосомных РНК. По общему размеру, структуре генома, составу генов и последовательностям он в значительной степени сходен с геномами других представителей семейства Астровые. Вместе с тем выявлены структурные различия, обусловленные сокращением или расширением участков инвертированных повторов; наиболее распространённой формой повторов были палиндромные последовательности. На основании анализа 12 полных пластидных геномов обнаружены три гипервариабельных участка (rpoB, rbcL и petL-trnP-UGG), которые могут использоваться в качестве потенциальных молекулярных маркеров.