Эффективность молекулярных тестов на основе анализа кала и методов его обработки для диагностики туберкулёза у детей: систематический обзор и метаанализ

Введение: Во всём мире предпринимаются усилия по совершенствованию диагностики туберкулёза у детей младшего возраста с использованием доступных биологических образцов, таких как кал. Целью исследования было провести систематический обзор точности молекулярных тестов на основе анализа кала для диагностики туберкулёза у детей и оценить влияние доступных методов предварительной обработки образцов и других характеристик дизайна исследований.

Методы: В этом систематическом обзоре и метаанализе оценивали исследования с участием детей младше 16 лет с предполагаемым туберкулёзом, опубликованные на английском, испанском, французском и португальском языках с 1 января 2000 года по 3 мая 2024 года и выявленные в базах данных MEDLINE, Embase и Embase Classic. В исследованиях молекулярное выявление ДНК Mycobacterium tuberculosis в кале сравнивали с результатами микробиологических тестов других образцов или с клиническим диагнозом. Исследования не исключали по географическому расположению, размеру выборки или дизайну, если они содержали первичные данные. Два независимых рецензента (LC-C и SM) оценивали соответствие критериям отбора по названиям, аннотациям и полнотекстовым публикациям, а также извлекали данные о характеристиках исследований, обследованных групп и диагностической эффективности. Если сведения, необходимые для основного анализа, отсутствовали в публикации, с соответствующими авторами связывались дополнительно. Для каждого исследования и для разных молекулярных тестов (Xpert MTB/RIF, Xpert Ultra MTB/RIF [Cepheid, Саннивейл, Калифорния, США] и других тестов) рассчитывали точечные оценки чувствительности и специфичности с 95% ДИ по сравнению с референтным стандартом (только посев, любое бактериологическое подтверждение или определение случая туберкулёза). Чувствительность и специфичность стратифицировали по методу обработки кала. Кроме того, оценивали дополнительный вклад исследования кала методом Xpert Ultra в бактериологическое подтверждение туберкулёза. Протокол зарегистрирован в PROSPERO (CRD42022341514).

Результаты: При поиске в базах данных выявлена 4521 публикация, ещё одна публикация — по библиографии статьи; 67 исследований отобраны для полнотекстового анализа. В качественный синтез включили 39 исследований, 35 из них — в метаанализ. При использовании в качестве референтного стандарта любого бактериологического подтверждения по образцу из дыхательных путей чувствительность Xpert в кале составила 0,60 (95% ДИ 0,48–0,71), Xpert Ultra в кале — 0,73 (0,63–0,81), а других объединённых оригинальных молекулярных методов — 0,44 (0,29–0,60). При использовании в качестве референтного стандарта определения случая туберкулёза чувствительность Xpert в кале составила 0,23 (0,11–0,41), Xpert Ultra в кале — 0,38 (0,22–0,56), а других оригинальных молекулярных методов — 0,17 (0,09–0,23). Добавление исследования кала методом Xpert Ultra увеличило долю бактериологически подтверждённых случаев туберкулёза в целом на 38,6%. Кроме того, применение упрощённых методов без центрифугирования повысило чувствительность Xpert Ultra в кале при использовании в качестве референтного стандарта любого бактериологического подтверждения: 0,77 (0,66–0,85) против 0,61 (0,41–0,78) при методах с центрифугированием.

Выводы: Этот систематический обзор и метаанализ подтверждает целесообразность использования Xpert Ultra в образцах кала для диагностики туберкулёза у детей. Исследование кала методом Xpert Ultra может увеличить долю бактериологически подтверждённых случаев в этой популяции, даже если одновременно исследуются образцы из дыхательных путей.

Финансирование: Программа EDCTP2, поддержанная Европейским союзом в рамках проекта Stool4TB, и Европейское общество детских инфекционных болезней.