Сравнительный транскрипционный анализ длинных некодирующих РНК при окислительном стрессе и воспалении, вызванных перманганатом калия и липополисахаридом, в тканях матки крыс

Перманганат калия (KMnO₄) — доступный антисептик, применяемый для внутриматочного промывания у коров при послеродовых инфекциях. Липополисахариды (ЛПС) хорошо изучены как индукторы воспаления и окислительного стресса. Хотя известно, что перманганат калия вызывает выраженное раздражение, окислительный стресс и токсическое повреждение тканей матки, его влияние на транскрипцию и способность вызывать молекулярное повреждение, сходное с действием ЛПС, изучены недостаточно. В этом исследовании окислительный стресс в тканях матки крыс Sprague–Dawley индуцировали перманганатом калия и сравнивали транскрипционные профили с профилями после воздействия ЛПС. Анализировали дифференциальную экспрессию длинных некодирующих РНК и матричных РНК, связанных с окислительным стрессом, токсическим повреждением и воспалением. Секвенирование РНК выявило 1125 дифференциально экспрессируемых матричных РНК в группе, получавшей перманганат калия, и 989 — в группе ЛПС. Кроме того, в группе перманганата калия дифференциально экспрессировались 1649 длинных некодирующих РНК, а в группе ЛПС — 1383. Анализ обогащения по онтологии генов и базам данных KEGG показал значимое обогащение 78 сигнальных путей в группе перманганата калия и 80 — в группе ЛПС; 50 путей были общими для обеих групп. Полученные данные характеризуют транскрипционные профили при воздействии перманганата калия и демонстрируют сходство вызванного им повреждения с повреждением, индуцированным ЛПС.