Иммунное профилирование метастазов увеальной меланомы в печени и ответ на ингибиторы контрольных точек иммунного ответа

Ответ на ингибиторы контрольных точек иммунного ответа (ИКИ) значительно различается у пациентов с увеальной меланомой (УМ) и кожной меланомой (КМ). Мы изучили иммунный профиль пациентов с метастатической УМ и выявили маркеры, предсказывающие более высокую выживаемость. Образцы метастазов в печени 189 пациентов с УМ и 48 пациентов с КМ анализировали на геномном и транскрипционном уровнях; анализ выживаемости проводили в подгруппе из 76 пациентов с метастатической УМ, получавших ИКИ. Метастазы УМ в печени, по-видимому, сохраняют геномные и иммунные характеристики первичной УМ, характеризуясь низкой частотой маркеров ответа на ИКИ и высокой частотой мутаций в генах GNA11, GNAQ, BAP1 и SF3B. По сравнению с метастазами КМ в печени метастазы УМ характеризовались меньшей инфильтрацией ряда иммунных клеток, но большей долей M2-макрофагов. В метастазах КМ в печени по сравнению с метастазами УМ отмечалась более высокая экспрессия генов контрольной точки G2/M и генов-мишеней E2F. Среди образцов метастатической УМ и КМ экспрессия генов путей G2/M и E2F была наиболее высокой в опухолях с высокой мутационной нагрузкой (TMB) и высокими показателями T-клеточного воспаления. У пациентов с метастатической УМ более высокая экспрессия LAG3, HLA класса I или HLA класса II ассоциировалась с большей медианой общей выживаемости; возможно, это характеризует небольшую долю иммунологически «горячих» опухолей. Профили экспрессии генов контрольной точки G2/M и генов-мишеней E2F позволяют предположить их возможный вклад в ответ на иммунотерапию.