Комплексный анализ выявляет ключевые гены, лежащие в основе двунаправленной связи между депрессией и почечной недостаточностью

Депрессия — частое психическое сопутствующее заболевание у пациентов с терминальной стадией почечной недостаточности. Однако биологические механизмы и точный характер взаимосвязи депрессии и почечной недостаточности остаются неясными. Несмотря на то что когнитивно-поведенческая терапия и физические упражнения помогают уменьшить симптомы, взаимодействие этих состояний и лежащие в его основе молекулярные механизмы изучены недостаточно. Проведён комплексный анализ, объединяющий биоинформатические методы и данные когорты UK Biobank (UKB). В исследовании UKB выявлена значимая связь между почечной недостаточностью и депрессией. Для выявления ключевых модулей коэкспрессии проанализировали данные об экспрессии генов из базы Gene Expression Omnibus (GEO) с помощью взвешенного анализа сетей коэкспрессии генов (WGCNA). Сети взаимодействия белок—белок (PPI) построили с использованием базы STRING, а инфильтрацию иммунных клеток оценили с помощью инструмента CIBERSORT. Данные UKB подтвердили устойчивую связь между почечной недостаточностью и депрессией. Биоинформатический анализ выявил значимое обогащение путей, связанных с острым воспалительным ответом, просветом специфических гранул и активностью иммунных рецепторов. В ходе анализа сети PPI были выявлены 23 центральных гена, в том числе CYP4F2, KCNA3, KISS1R, LILRA5 и ZC3H12D, которые могут играть ключевую роль в общей патофизиологии терминальной стадии почечной недостаточности и депрессии. Валидационные исследования дополнительно подтвердили роль LILRA5, CYP4F2 и KISS1R в этих механизмах. Полученные результаты дают новые сведения о молекулярных и иммунных взаимодействиях, лежащих в основе сочетания почечной недостаточности и депрессии. Объединение анализа когорты и биоинформатических методов позволило выявить потенциальные терапевтические мишени и биологические пути, которые могут послужить основой для разработки новых стратегий лечения.